化学原料药的废水来源包括车间工艺用水、设备管线清场清洗废水、药物提取或精制工序固液分离产生的废水、车间员工清洁用水及厂区生活废水等。同时，废水来源还包括锅炉排污水、外排的冷却水等。在企业的废水中，废水中则溶入了生产过程中使用的全部物料的成分，其中包括药物中间体、未知物和目标物(残留的产品);还包括废水在混合有氧与缺氧条件下的新产物。
在国家水专项调研中，制药企业的达标状况堪忧：能够达到制药行业水污染物排放新标准限值的制药企业数量相当少，化学合成类、发酵类、制剂类制药废水达标率分别为9%、12%和30%。
另据调查，目前国内大部分城镇污水处理厂对制药工业废水的纳水要求为COD≤300mg/L，即使这样，仍有部分化学合成类、发酵类制药企业达不到要求，化学合成类比例高达46%，发酵类为16%��
化学原料药生产废水处理难度大的另一个原因，就是企业根据市场需求经常调整产品与产量，新生产状况产生的污染负荷与原处理设施的生物系统、运行参数发生冲突，往往会造成一段时间不达标的问题。
化学原料药中的废水一般成分复杂，污染物浓度高，含有大量有毒、有害物质、生物抑制物(包括一定浓度的抗生素)、难降解物质等，带有颜色和气味，悬浮物含量高，易产生泡沫等。
化学原料药中废水水质特点
化学原料药中废水中主要含有各种天然的有机物,其主要成分为糖类、有机酸、苷类、蒽醌、木质素、生物碱、但宁、鞣质、蛋白质、淀粉及它们的水解物等。制药废水中含有许多生物难降解的环状化合物、杂环化合物、有机磷、有机氯、苯酚及不饱和脂肪类化合物。这些物质的去除或转化是制药废水COD去除的重要途径。中药材废水主要污染物为高浓度有机废水的污染，对于中药制药工业，由于药物生产过程中不同药物品种和生产工艺不同，所产生的废水水质及水量有很大的差别，而且由于产品更换周期短，随着产品的更换，废水水质、水量经常波动，极不稳定。中药废水的另一个特点是有机污染物浓度高，悬浮物，尤其是木质素等比重较轻、难于沉淀的有机物含量高，色度较高，废水的可生化性较好，多为间歇排放，污水成分复杂，水质水量变化较大。
离心萃取机处理化学原料药中的含酚废水意义
由于离心萃取机具有占地面积小、处理能力大、密闭性能好等特点，根据分离要求，处理能力和体系特性的不同可设计成不同的结构，可节省大量的萃取剂的费用，脱酚率达95%以上。目前国内各企业工业废水年排放约400亿吨，其中含酚工业废水约占0.5%左右，约20亿吨。据市场调研，预计国内排放含酚工业废水的总量的30%左右可采用离心萃取机脱酚，总共需要离心萃取机上千台以上。
